Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cops9Q3U898 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cops9Q3U898 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops9Q3U898 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops9Q3U898 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cops9Q3U898 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cops9Q3U898 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms