Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T9

Dennd1b, DENN domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd1bQ3U1T9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dennd1bQ3U1T9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dennd1bQ3U1T9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dennd1bQ3U1T9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dennd1bQ3U1T9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dennd1bQ3U1T9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dennd1bQ3U1T9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dennd1bQ3U1T9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dennd1bQ3U1T9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dennd1bQ3U1T9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dennd1bQ3U1T9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dennd1bQ3U1T9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dennd1bQ3U1T9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dennd1bQ3U1T9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Dennd1bQ3U1T9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dennd1bQ3U1T9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dennd1bQ3U1T9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dennd1bQ3U1T9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dennd1bQ3U1T9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dennd1bQ3U1T9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dennd1bQ3U1T9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dennd1bQ3U1T9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dennd1bQ3U1T9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dennd1bQ3U1T9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dennd1bQ3U1T9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dennd1bQ3U1T9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Dennd1bQ3U1T9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dennd1bQ3U1T9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dennd1bQ3U1T9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dennd1bQ3U1T9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dennd1bQ3U1T9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dennd1bQ3U1T9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Dennd1bQ3U1T9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dennd1bQ3U1T9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dennd1bQ3U1T9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dennd1bQ3U1T9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Dennd1bQ3U1T9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dennd1bQ3U1T9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dennd1bQ3U1T9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dennd1bQ3U1T9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dennd1bQ3U1T9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dennd1bQ3U1T9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dennd1bQ3U1T9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dennd1bQ3U1T9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dennd1bQ3U1T9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dennd1bQ3U1T9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dennd1bQ3U1T9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dennd1bQ3U1T9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dennd1bQ3U1T9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dennd1bQ3U1T9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dennd1bQ3U1T9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms