Protein–RNA interactions for Protein: Q3U108

Arid5a, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid5aQ3U108 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms