Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc28Q3TX51 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc28Q3TX51 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc28Q3TX51 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc28Q3TX51 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc28Q3TX51 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc28Q3TX51 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc28Q3TX51 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc28Q3TX51 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc28Q3TX51 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc28Q3TX51 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc28Q3TX51 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc28Q3TX51 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc28Q3TX51 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc28Q3TX51 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc28Q3TX51 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc28Q3TX51 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc28Q3TX51 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc28Q3TX51 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc28Q3TX51 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc28Q3TX51 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc28Q3TX51 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrc28Q3TX51 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc28Q3TX51 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc28Q3TX51 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc28Q3TX51 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc28Q3TX51 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc28Q3TX51 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc28Q3TX51 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc28Q3TX51 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc28Q3TX51 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc28Q3TX51 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc28Q3TX51 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms