Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700066B19RikQ3TS39 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700066B19RikQ3TS39 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700066B19RikQ3TS39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700066B19RikQ3TS39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700066B19RikQ3TS39 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700066B19RikQ3TS39 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700066B19RikQ3TS39 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700066B19RikQ3TS39 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700066B19RikQ3TS39 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700066B19RikQ3TS39 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700066B19RikQ3TS39 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700066B19RikQ3TS39 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700066B19RikQ3TS39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700066B19RikQ3TS39 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700066B19RikQ3TS39 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700066B19RikQ3TS39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700066B19RikQ3TS39 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700066B19RikQ3TS39 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700066B19RikQ3TS39 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms