Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gtf3c3Q3TMP1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gtf3c3Q3TMP1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gtf3c3Q3TMP1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gtf3c3Q3TMP1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gtf3c3Q3TMP1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gtf3c3Q3TMP1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gtf3c3Q3TMP1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gtf3c3Q3TMP1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gtf3c3Q3TMP1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gtf3c3Q3TMP1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gtf3c3Q3TMP1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Gtf3c3Q3TMP1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf3c3Q3TMP1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms