Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
RubcnlQ3TD16 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
RubcnlQ3TD16 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
RubcnlQ3TD16 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30,24■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
RubcnlQ3TD16 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
RubcnlQ3TD16 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
RubcnlQ3TD16 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
RubcnlQ3TD16 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
RubcnlQ3TD16 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
RubcnlQ3TD16 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
RubcnlQ3TD16 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
RubcnlQ3TD16 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30,13■■■□□ 2,41
RubcnlQ3TD16 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
RubcnlQ3TD16 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
RubcnlQ3TD16 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
RubcnlQ3TD16 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30,1■■■□□ 2,41
RubcnlQ3TD16 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
RubcnlQ3TD16 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
RubcnlQ3TD16 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
RubcnlQ3TD16 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
RubcnlQ3TD16 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
RubcnlQ3TD16 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
RubcnlQ3TD16 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
RubcnlQ3TD16 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
RubcnlQ3TD16 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
RubcnlQ3TD16 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
RubcnlQ3TD16 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
RubcnlQ3TD16 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
RubcnlQ3TD16 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
RubcnlQ3TD16 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,96■■■□□ 2,39
RubcnlQ3TD16 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
RubcnlQ3TD16 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,95■■■□□ 2,39
RubcnlQ3TD16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
RubcnlQ3TD16 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
RubcnlQ3TD16 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
RubcnlQ3TD16 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
RubcnlQ3TD16 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
RubcnlQ3TD16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
RubcnlQ3TD16 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
RubcnlQ3TD16 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,9■■■□□ 2,38
RubcnlQ3TD16 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
RubcnlQ3TD16 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
RubcnlQ3TD16 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
RubcnlQ3TD16 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
RubcnlQ3TD16 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
RubcnlQ3TD16 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
RubcnlQ3TD16 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
RubcnlQ3TD16 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
RubcnlQ3TD16 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,78■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,36
RubcnlQ3TD16 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
RubcnlQ3TD16 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
RubcnlQ3TD16 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
RubcnlQ3TD16 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
RubcnlQ3TD16 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
RubcnlQ3TD16 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
RubcnlQ3TD16 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
RubcnlQ3TD16 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
RubcnlQ3TD16 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,34
RubcnlQ3TD16 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
RubcnlQ3TD16 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
RubcnlQ3TD16 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,67■■■□□ 2,34
RubcnlQ3TD16 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
RubcnlQ3TD16 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
RubcnlQ3TD16 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
RubcnlQ3TD16 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
RubcnlQ3TD16 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
RubcnlQ3TD16 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
RubcnlQ3TD16 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,63■■■□□ 2,33
RubcnlQ3TD16 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
RubcnlQ3TD16 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
RubcnlQ3TD16 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
RubcnlQ3TD16 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
RubcnlQ3TD16 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
RubcnlQ3TD16 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms