Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBT3

Tmem173, Stimulator of interferon genes protein, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem173Q3TBT3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem173Q3TBT3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem173Q3TBT3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem173Q3TBT3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem173Q3TBT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem173Q3TBT3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem173Q3TBT3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem173Q3TBT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem173Q3TBT3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem173Q3TBT3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem173Q3TBT3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem173Q3TBT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem173Q3TBT3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem173Q3TBT3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem173Q3TBT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem173Q3TBT3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem173Q3TBT3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem173Q3TBT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem173Q3TBT3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem173Q3TBT3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem173Q3TBT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms