Protein–RNA interactions for Protein: Q3LS21

Kcnk9, Potassium channel subfamily K member 9, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk9Q3LS21 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnk9Q3LS21 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnk9Q3LS21 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnk9Q3LS21 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnk9Q3LS21 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnk9Q3LS21 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnk9Q3LS21 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnk9Q3LS21 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnk9Q3LS21 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnk9Q3LS21 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnk9Q3LS21 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnk9Q3LS21 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnk9Q3LS21 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnk9Q3LS21 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnk9Q3LS21 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnk9Q3LS21 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnk9Q3LS21 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms