Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Treml4Q3LRV9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Treml4Q3LRV9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Treml4Q3LRV9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Treml4Q3LRV9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Treml4Q3LRV9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Treml4Q3LRV9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Treml4Q3LRV9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Treml4Q3LRV9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Treml4Q3LRV9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Treml4Q3LRV9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Treml4Q3LRV9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Treml4Q3LRV9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Treml4Q3LRV9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Treml4Q3LRV9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Treml4Q3LRV9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Treml4Q3LRV9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Treml4Q3LRV9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Treml4Q3LRV9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Treml4Q3LRV9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Treml4Q3LRV9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Treml4Q3LRV9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Treml4Q3LRV9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Treml4Q3LRV9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Treml4Q3LRV9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Treml4Q3LRV9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
Treml4Q3LRV9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Treml4Q3LRV9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Treml4Q3LRV9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Treml4Q3LRV9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Treml4Q3LRV9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Treml4Q3LRV9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Treml4Q3LRV9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Treml4Q3LRV9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Treml4Q3LRV9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Treml4Q3LRV9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Treml4Q3LRV9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Treml4Q3LRV9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Treml4Q3LRV9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Treml4Q3LRV9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Treml4Q3LRV9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Treml4Q3LRV9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Treml4Q3LRV9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Treml4Q3LRV9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Treml4Q3LRV9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23,48■■□□□ 1,35
Treml4Q3LRV9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,47■■□□□ 1,35
Treml4Q3LRV9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Treml4Q3LRV9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Treml4Q3LRV9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Treml4Q3LRV9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Treml4Q3LRV9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Treml4Q3LRV9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Treml4Q3LRV9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Treml4Q3LRV9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Treml4Q3LRV9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Treml4Q3LRV9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,4 ms