Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIS4

Flg2, Filaggrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flg2Q2VIS4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Flg2Q2VIS4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Flg2Q2VIS4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Flg2Q2VIS4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Flg2Q2VIS4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Flg2Q2VIS4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Flg2Q2VIS4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Flg2Q2VIS4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Flg2Q2VIS4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Flg2Q2VIS4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Flg2Q2VIS4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Flg2Q2VIS4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flg2Q2VIS4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Flg2Q2VIS4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Flg2Q2VIS4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Flg2Q2VIS4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flg2Q2VIS4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flg2Q2VIS4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flg2Q2VIS4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Flg2Q2VIS4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Flg2Q2VIS4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Flg2Q2VIS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Flg2Q2VIS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Flg2Q2VIS4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Flg2Q2VIS4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Flg2Q2VIS4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Flg2Q2VIS4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Flg2Q2VIS4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Flg2Q2VIS4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Flg2Q2VIS4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Flg2Q2VIS4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms