Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38,23■■■■□ 3,71
Trpm1Q2TV84 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Trpm1Q2TV84 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Trpm1Q2TV84 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,22■■■■□ 3,71
Trpm1Q2TV84 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,21■■■■□ 3,71
Trpm1Q2TV84 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Trpm1Q2TV84 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,19■■■■□ 3,7
Trpm1Q2TV84 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Trpm1Q2TV84 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Trpm1Q2TV84 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Trpm1Q2TV84 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38,16■■■■□ 3,7
Trpm1Q2TV84 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Trpm1Q2TV84 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38,14■■■■□ 3,7
Trpm1Q2TV84 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Trpm1Q2TV84 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Trpm1Q2TV84 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,07■■■■□ 3,68
Trpm1Q2TV84 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,06■■■■□ 3,68
Trpm1Q2TV84 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Trpm1Q2TV84 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Trpm1Q2TV84 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,67
Trpm1Q2TV84 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38,01■■■■□ 3,67
Trpm1Q2TV84 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Trpm1Q2TV84 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Trpm1Q2TV84 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Trpm1Q2TV84 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,96■■■■□ 3,67
Trpm1Q2TV84 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Trpm1Q2TV84 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Trpm1Q2TV84 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,94■■■■□ 3,66
Trpm1Q2TV84 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,92■■■■□ 3,66
Trpm1Q2TV84 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37,92■■■■□ 3,66
Trpm1Q2TV84 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Trpm1Q2TV84 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37,88■■■■□ 3,65
Trpm1Q2TV84 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Trpm1Q2TV84 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Trpm1Q2TV84 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Trpm1Q2TV84 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Trpm1Q2TV84 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Trpm1Q2TV84 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Trpm1Q2TV84 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Trpm1Q2TV84 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Trpm1Q2TV84 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Trpm1Q2TV84 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Trpm1Q2TV84 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37,69■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,67■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37,64■■■■□ 3,62
Trpm1Q2TV84 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37,6■■■■□ 3,61
Trpm1Q2TV84 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Trpm1Q2TV84 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Trpm1Q2TV84 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Trpm1Q2TV84 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Trpm1Q2TV84 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Trpm1Q2TV84 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Trpm1Q2TV84 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Trpm1Q2TV84 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Trpm1Q2TV84 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37,51■■■■□ 3,6
Trpm1Q2TV84 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37,51■■■■□ 3,6
Trpm1Q2TV84 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37,51■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37,49■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37,47■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Trpm1Q2TV84 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,42■■■■□ 3,58
Trpm1Q2TV84 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Trpm1Q2TV84 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37,41■■■■□ 3,58
Trpm1Q2TV84 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
Trpm1Q2TV84 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37,3■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37,3■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37,3■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,29■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Trpm1Q2TV84 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms