Protein–RNA interactions for Protein: Q2EG98

Pkd1l3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l3Q2EG98 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd1l3Q2EG98 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd1l3Q2EG98 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd1l3Q2EG98 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd1l3Q2EG98 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd1l3Q2EG98 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd1l3Q2EG98 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd1l3Q2EG98 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd1l3Q2EG98 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd1l3Q2EG98 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkd1l3Q2EG98 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkd1l3Q2EG98 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd1l3Q2EG98 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd1l3Q2EG98 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd1l3Q2EG98 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd1l3Q2EG98 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd1l3Q2EG98 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd1l3Q2EG98 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd1l3Q2EG98 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd1l3Q2EG98 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd1l3Q2EG98 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd1l3Q2EG98 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd1l3Q2EG98 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd1l3Q2EG98 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd1l3Q2EG98 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd1l3Q2EG98 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd1l3Q2EG98 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd1l3Q2EG98 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd1l3Q2EG98 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd1l3Q2EG98 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd1l3Q2EG98 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd1l3Q2EG98 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd1l3Q2EG98 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd1l3Q2EG98 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd1l3Q2EG98 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd1l3Q2EG98 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd1l3Q2EG98 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd1l3Q2EG98 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd1l3Q2EG98 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd1l3Q2EG98 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd1l3Q2EG98 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms