Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4930480E11RikQ0VG34 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930480E11RikQ0VG34 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
4930480E11RikQ0VG34 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930480E11RikQ0VG34 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930480E11RikQ0VG34 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930480E11RikQ0VG34 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930480E11RikQ0VG34 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930480E11RikQ0VG34 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930480E11RikQ0VG34 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930480E11RikQ0VG34 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930480E11RikQ0VG34 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4930480E11RikQ0VG34 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930480E11RikQ0VG34 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930480E11RikQ0VG34 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4930480E11RikQ0VG34 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930480E11RikQ0VG34 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930480E11RikQ0VG34 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4930480E11RikQ0VG34 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930480E11RikQ0VG34 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930480E11RikQ0VG34 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930480E11RikQ0VG34 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4930480E11RikQ0VG34 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms