Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MestQ07646 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MestQ07646 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MestQ07646 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MestQ07646 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MestQ07646 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MestQ07646 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MestQ07646 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MestQ07646 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MestQ07646 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MestQ07646 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MestQ07646 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MestQ07646 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MestQ07646 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MestQ07646 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MestQ07646 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MestQ07646 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MestQ07646 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MestQ07646 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MestQ07646 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MestQ07646 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MestQ07646 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MestQ07646 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MestQ07646 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MestQ07646 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MestQ07646 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MestQ07646 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MestQ07646 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MestQ07646 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MestQ07646 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MestQ07646 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MestQ07646 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MestQ07646 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MestQ07646 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MestQ07646 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MestQ07646 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MestQ07646 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MestQ07646 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MestQ07646 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MestQ07646 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MestQ07646 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MestQ07646 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MestQ07646 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MestQ07646 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MestQ07646 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MestQ07646 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MestQ07646 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MestQ07646 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MestQ07646 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MestQ07646 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MestQ07646 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MestQ07646 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MestQ07646 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MestQ07646 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MestQ07646 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MestQ07646 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MestQ07646 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MestQ07646 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MestQ07646 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MestQ07646 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MestQ07646 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MestQ07646 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MestQ07646 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MestQ07646 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MestQ07646 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MestQ07646 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MestQ07646 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MestQ07646 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MestQ07646 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MestQ07646 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MestQ07646 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MestQ07646 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MestQ07646 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MestQ07646 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MestQ07646 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MestQ07646 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MestQ07646 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MestQ07646 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MestQ07646 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MestQ07646 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MestQ07646 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MestQ07646 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MestQ07646 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MestQ07646 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MestQ07646 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MestQ07646 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MestQ07646 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MestQ07646 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MestQ07646 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MestQ07646 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MestQ07646 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MestQ07646 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MestQ07646 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MestQ07646 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MestQ07646 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MestQ07646 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MestQ07646 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MestQ07646 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MestQ07646 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MestQ07646 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms