Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdf9Q07105 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gdf9Q07105 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdf9Q07105 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf9Q07105 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gdf9Q07105 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gdf9Q07105 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdf9Q07105 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gdf9Q07105 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdf9Q07105 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms