Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RelaQ04207 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RelaQ04207 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RelaQ04207 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RelaQ04207 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RelaQ04207 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RelaQ04207 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RelaQ04207 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RelaQ04207 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RelaQ04207 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RelaQ04207 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RelaQ04207 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RelaQ04207 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RelaQ04207 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RelaQ04207 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RelaQ04207 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RelaQ04207 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RelaQ04207 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RelaQ04207 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RelaQ04207 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RelaQ04207 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RelaQ04207 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RelaQ04207 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RelaQ04207 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RelaQ04207 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RelaQ04207 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RelaQ04207 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RelaQ04207 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RelaQ04207 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RelaQ04207 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RelaQ04207 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RelaQ04207 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RelaQ04207 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RelaQ04207 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RelaQ04207 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RelaQ04207 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RelaQ04207 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RelaQ04207 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RelaQ04207 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RelaQ04207 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RelaQ04207 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RelaQ04207 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RelaQ04207 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RelaQ04207 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RelaQ04207 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RelaQ04207 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RelaQ04207 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RelaQ04207 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RelaQ04207 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RelaQ04207 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RelaQ04207 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms