Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thbs2Q03350 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thbs2Q03350 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thbs2Q03350 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thbs2Q03350 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thbs2Q03350 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thbs2Q03350 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs2Q03350 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs2Q03350 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs2Q03350 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thbs2Q03350 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thbs2Q03350 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs2Q03350 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thbs2Q03350 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Thbs2Q03350 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Thbs2Q03350 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thbs2Q03350 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thbs2Q03350 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thbs2Q03350 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs2Q03350 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs2Q03350 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thbs2Q03350 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Thbs2Q03350 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thbs2Q03350 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thbs2Q03350 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thbs2Q03350 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thbs2Q03350 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thbs2Q03350 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thbs2Q03350 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thbs2Q03350 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thbs2Q03350 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thbs2Q03350 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thbs2Q03350 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs2Q03350 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs2Q03350 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs2Q03350 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2779.6 ms