Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Runx1Q03347 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Runx1Q03347 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Runx1Q03347 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Runx1Q03347 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Runx1Q03347 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Runx1Q03347 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Runx1Q03347 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Runx1Q03347 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Runx1Q03347 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Runx1Q03347 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Runx1Q03347 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Runx1Q03347 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Runx1Q03347 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms