Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PrkczQ02956 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PrkczQ02956 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PrkczQ02956 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PrkczQ02956 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PrkczQ02956 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PrkczQ02956 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PrkczQ02956 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PrkczQ02956 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrkczQ02956 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrkczQ02956 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrkczQ02956 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PrkczQ02956 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PrkczQ02956 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PrkczQ02956 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrkczQ02956 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrkczQ02956 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrkczQ02956 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PrkczQ02956 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PrkczQ02956 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrkczQ02956 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrkczQ02956 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrkczQ02956 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PrkczQ02956 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrkczQ02956 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PrkczQ02956 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PrkczQ02956 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PrkczQ02956 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PrkczQ02956 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrkczQ02956 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrkczQ02956 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrkczQ02956 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrkczQ02956 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrkczQ02956 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PrkczQ02956 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PrkczQ02956 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PrkczQ02956 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrkczQ02956 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrkczQ02956 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PrkczQ02956 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PrkczQ02956 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PrkczQ02956 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PrkczQ02956 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PrkczQ02956 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PrkczQ02956 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PrkczQ02956 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrkczQ02956 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PrkczQ02956 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PrkczQ02956 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PrkczQ02956 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PrkczQ02956 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PrkczQ02956 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PrkczQ02956 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrkczQ02956 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrkczQ02956 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrkczQ02956 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrkczQ02956 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrkczQ02956 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrkczQ02956 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PrkczQ02956 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrkczQ02956 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrkczQ02956 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrkczQ02956 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrkczQ02956 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrkczQ02956 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PrkczQ02956 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PrkczQ02956 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PrkczQ02956 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PrkczQ02956 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PrkczQ02956 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PrkczQ02956 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PrkczQ02956 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PrkczQ02956 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PrkczQ02956 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrkczQ02956 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrkczQ02956 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrkczQ02956 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PrkczQ02956 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PrkczQ02956 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrkczQ02956 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms