Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp39Q02525 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp39Q02525 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp39Q02525 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp39Q02525 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp39Q02525 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp39Q02525 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp39Q02525 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp39Q02525 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp39Q02525 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp39Q02525 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp39Q02525 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp39Q02525 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp39Q02525 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp39Q02525 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp39Q02525 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp39Q02525 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp39Q02525 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp39Q02525 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp39Q02525 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp39Q02525 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfp39Q02525 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp39Q02525 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp39Q02525 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp39Q02525 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp39Q02525 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp39Q02525 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms