Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrkcqQ02111 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkcqQ02111 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrkcqQ02111 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrkcqQ02111 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkcqQ02111 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrkcqQ02111 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcqQ02111 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcqQ02111 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcqQ02111 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcqQ02111 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcqQ02111 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcqQ02111 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrkcqQ02111 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PrkcqQ02111 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrkcqQ02111 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrkcqQ02111 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrkcqQ02111 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcqQ02111 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcqQ02111 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcqQ02111 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcqQ02111 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrkcqQ02111 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcqQ02111 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrkcqQ02111 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrkcqQ02111 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcqQ02111 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkcqQ02111 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcqQ02111 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcqQ02111 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkcqQ02111 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkcqQ02111 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcqQ02111 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcqQ02111 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcqQ02111 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcqQ02111 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcqQ02111 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkcqQ02111 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcqQ02111 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PrkcqQ02111 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkcqQ02111 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms