Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
HmgcrQ01237 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
HmgcrQ01237 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
HmgcrQ01237 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
HmgcrQ01237 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
HmgcrQ01237 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
HmgcrQ01237 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
HmgcrQ01237 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
HmgcrQ01237 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
HmgcrQ01237 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
HmgcrQ01237 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
HmgcrQ01237 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,47■■■□□ 2,15
HmgcrQ01237 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
HmgcrQ01237 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
HmgcrQ01237 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
HmgcrQ01237 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
HmgcrQ01237 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
HmgcrQ01237 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
HmgcrQ01237 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
HmgcrQ01237 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
HmgcrQ01237 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
HmgcrQ01237 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
HmgcrQ01237 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
HmgcrQ01237 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
HmgcrQ01237 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
HmgcrQ01237 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
HmgcrQ01237 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
HmgcrQ01237 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
HmgcrQ01237 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
HmgcrQ01237 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
HmgcrQ01237 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
HmgcrQ01237 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
HmgcrQ01237 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
HmgcrQ01237 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
HmgcrQ01237 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
HmgcrQ01237 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
HmgcrQ01237 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
HmgcrQ01237 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
HmgcrQ01237 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
HmgcrQ01237 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
HmgcrQ01237 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
HmgcrQ01237 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
HmgcrQ01237 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,22■■■□□ 2,11
HmgcrQ01237 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
HmgcrQ01237 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
HmgcrQ01237 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,15■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
HmgcrQ01237 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,12■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
HmgcrQ01237 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
HmgcrQ01237 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
HmgcrQ01237 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
HmgcrQ01237 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
HmgcrQ01237 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
HmgcrQ01237 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
HmgcrQ01237 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
HmgcrQ01237 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,95■■■□□ 2,06
HmgcrQ01237 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
HmgcrQ01237 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms