Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Serpina1eQ00898 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Serpina1eQ00898 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Serpina1eQ00898 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Serpina1eQ00898 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Serpina1eQ00898 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Serpina1eQ00898 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Serpina1eQ00898 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Serpina1eQ00898 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Serpina1eQ00898 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Serpina1eQ00898 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Serpina1eQ00898 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Serpina1eQ00898 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Serpina1eQ00898 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Serpina1eQ00898 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Serpina1eQ00898 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Serpina1eQ00898 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Serpina1eQ00898 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Serpina1eQ00898 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Serpina1eQ00898 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Serpina1eQ00898 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Serpina1eQ00898 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Serpina1eQ00898 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Serpina1eQ00898 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Serpina1eQ00898 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Serpina1eQ00898 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms