Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8a1Q00558 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8a1Q00558 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F8a1Q00558 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
F8a1Q00558 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8a1Q00558 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8a1Q00558 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F8a1Q00558 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
F8a1Q00558 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8a1Q00558 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
F8a1Q00558 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8a1Q00558 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8a1Q00558 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8a1Q00558 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
F8a1Q00558 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
F8a1Q00558 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F8a1Q00558 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F8a1Q00558 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F8a1Q00558 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F8a1Q00558 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8a1Q00558 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8a1Q00558 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8a1Q00558 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
F8a1Q00558 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8a1Q00558 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
F8a1Q00558 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8a1Q00558 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8a1Q00558 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8a1Q00558 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8a1Q00558 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8a1Q00558 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8a1Q00558 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8a1Q00558 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F8a1Q00558 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8a1Q00558 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8a1Q00558 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8a1Q00558 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms