Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim43cP86449 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim43cP86449 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim43cP86449 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim43cP86449 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim43cP86449 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim43cP86449 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim43cP86449 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim43cP86449 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim43cP86449 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim43cP86449 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim43cP86449 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim43cP86449 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim43cP86449 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim43cP86449 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim43cP86449 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim43cP86449 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim43cP86449 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim43cP86449 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim43cP86449 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim43cP86449 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim43cP86449 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim43cP86449 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim43cP86449 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim43cP86449 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim43cP86449 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim43cP86449 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim43cP86449 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim43cP86449 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim43cP86449 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim43cP86449 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim43cP86449 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim43cP86449 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim43cP86449 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim43cP86449 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim43cP86449 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim43cP86449 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim43cP86449 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim43cP86449 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim43cP86449 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim43cP86449 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim43cP86449 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim43cP86449 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim43cP86449 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim43cP86449 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim43cP86449 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms