Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ldb1P70662 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ldb1P70662 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ldb1P70662 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ldb1P70662 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ldb1P70662 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ldb1P70662 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ldb1P70662 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ldb1P70662 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ldb1P70662 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ldb1P70662 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ldb1P70662 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ldb1P70662 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ldb1P70662 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ldb1P70662 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ldb1P70662 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ldb1P70662 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ldb1P70662 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ldb1P70662 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ldb1P70662 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ldb1P70662 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ldb1P70662 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ldb1P70662 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ldb1P70662 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms