Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh10P70408 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh10P70408 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh10P70408 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh10P70408 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh10P70408 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh10P70408 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh10P70408 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms