Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SeboxP70368 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SeboxP70368 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SeboxP70368 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SeboxP70368 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SeboxP70368 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SeboxP70368 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SeboxP70368 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SeboxP70368 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SeboxP70368 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SeboxP70368 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SeboxP70368 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SeboxP70368 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SeboxP70368 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SeboxP70368 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SeboxP70368 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SeboxP70368 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SeboxP70368 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SeboxP70368 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SeboxP70368 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms