Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Msx3P70354 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Msx3P70354 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Msx3P70354 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Msx3P70354 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Msx3P70354 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Msx3P70354 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Msx3P70354 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Msx3P70354 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Msx3P70354 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Msx3P70354 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Msx3P70354 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Msx3P70354 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Msx3P70354 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Msx3P70354 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Msx3P70354 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Msx3P70354 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msx3P70354 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msx3P70354 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msx3P70354 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msx3P70354 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msx3P70354 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msx3P70354 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msx3P70354 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msx3P70354 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msx3P70354 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Msx3P70354 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Msx3P70354 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Msx3P70354 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msx3P70354 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msx3P70354 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msx3P70354 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msx3P70354 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msx3P70354 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Msx3P70354 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msx3P70354 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msx3P70354 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msx3P70354 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msx3P70354 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Msx3P70354 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msx3P70354 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Msx3P70354 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Msx3P70354 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Msx3P70354 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Msx3P70354 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Msx3P70354 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Msx3P70354 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Msx3P70354 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Msx3P70354 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Msx3P70354 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Msx3P70354 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Msx3P70354 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msx3P70354 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms