Protein–RNA interactions for Protein: P70269

Ctse, Cathepsin E, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtseP70269 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtseP70269 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtseP70269 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtseP70269 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtseP70269 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtseP70269 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtseP70269 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtseP70269 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtseP70269 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtseP70269 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtseP70269 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CtseP70269 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CtseP70269 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtseP70269 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtseP70269 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtseP70269 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtseP70269 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtseP70269 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtseP70269 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtseP70269 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtseP70269 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtseP70269 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtseP70269 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtseP70269 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtseP70269 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtseP70269 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtseP70269 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtseP70269 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtseP70269 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtseP70269 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CtseP70269 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtseP70269 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtseP70269 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtseP70269 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtseP70269 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtseP70269 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtseP70269 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtseP70269 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtseP70269 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtseP70269 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtseP70269 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtseP70269 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtseP70269 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtseP70269 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtseP70269 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtseP70269 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtseP70269 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtseP70269 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CtseP70269 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtseP70269 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtseP70269 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtseP70269 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtseP70269 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtseP70269 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtseP70269 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtseP70269 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtseP70269 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtseP70269 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtseP70269 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtseP70269 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtseP70269 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CtseP70269 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtseP70269 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtseP70269 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtseP70269 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtseP70269 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtseP70269 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtseP70269 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtseP70269 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtseP70269 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtseP70269 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtseP70269 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtseP70269 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtseP70269 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtseP70269 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtseP70269 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CtseP70269 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtseP70269 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtseP70269 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtseP70269 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtseP70269 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtseP70269 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtseP70269 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtseP70269 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtseP70269 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtseP70269 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtseP70269 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtseP70269 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CtseP70269 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtseP70269 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtseP70269 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtseP70269 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtseP70269 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtseP70269 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtseP70269 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtseP70269 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtseP70269 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CtseP70269 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtseP70269 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtseP70269 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms