Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NficP70255 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NficP70255 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NficP70255 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NficP70255 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NficP70255 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NficP70255 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NficP70255 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NficP70255 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NficP70255 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NficP70255 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NficP70255 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NficP70255 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NficP70255 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NficP70255 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NficP70255 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NficP70255 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NficP70255 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NficP70255 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NficP70255 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NficP70255 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NficP70255 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NficP70255 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NficP70255 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NficP70255 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NficP70255 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NficP70255 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NficP70255 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NficP70255 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NficP70255 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NficP70255 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NficP70255 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NficP70255 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NficP70255 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NficP70255 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NficP70255 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NficP70255 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NficP70255 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NficP70255 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NficP70255 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NficP70255 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NficP70255 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NficP70255 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NficP70255 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NficP70255 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NficP70255 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NficP70255 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NficP70255 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NficP70255 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NficP70255 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NficP70255 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NficP70255 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NficP70255 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NficP70255 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NficP70255 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NficP70255 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NficP70255 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NficP70255 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NficP70255 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NficP70255 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NficP70255 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NficP70255 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NficP70255 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NficP70255 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NficP70255 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NficP70255 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NficP70255 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NficP70255 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NficP70255 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NficP70255 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NficP70255 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NficP70255 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NficP70255 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NficP70255 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NficP70255 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NficP70255 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NficP70255 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NficP70255 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NficP70255 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NficP70255 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NficP70255 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NficP70255 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NficP70255 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NficP70255 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NficP70255 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NficP70255 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NficP70255 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NficP70255 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NficP70255 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NficP70255 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NficP70255 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NficP70255 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NficP70255 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NficP70255 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NficP70255 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NficP70255 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NficP70255 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NficP70255 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NficP70255 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NficP70255 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms