Protein–RNA interactions for Protein: P70227

Itpr3, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itpr3P70227 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itpr3P70227 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itpr3P70227 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itpr3P70227 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Itpr3P70227 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Itpr3P70227 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itpr3P70227 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itpr3P70227 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itpr3P70227 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itpr3P70227 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itpr3P70227 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itpr3P70227 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itpr3P70227 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itpr3P70227 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itpr3P70227 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itpr3P70227 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itpr3P70227 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itpr3P70227 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itpr3P70227 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itpr3P70227 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itpr3P70227 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itpr3P70227 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itpr3P70227 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itpr3P70227 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itpr3P70227 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itpr3P70227 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itpr3P70227 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itpr3P70227 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Itpr3P70227 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itpr3P70227 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itpr3P70227 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itpr3P70227 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Itpr3P70227 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itpr3P70227 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itpr3P70227 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itpr3P70227 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itpr3P70227 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itpr3P70227 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itpr3P70227 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itpr3P70227 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itpr3P70227 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Itpr3P70227 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itpr3P70227 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itpr3P70227 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itpr3P70227 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itpr3P70227 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itpr3P70227 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itpr3P70227 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itpr3P70227 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itpr3P70227 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itpr3P70227 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itpr3P70227 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itpr3P70227 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itpr3P70227 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itpr3P70227 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itpr3P70227 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itpr3P70227 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itpr3P70227 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itpr3P70227 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itpr3P70227 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itpr3P70227 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itpr3P70227 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itpr3P70227 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itpr3P70227 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itpr3P70227 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itpr3P70227 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms