Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf6P70196 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf6P70196 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf6P70196 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf6P70196 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf6P70196 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf6P70196 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf6P70196 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf6P70196 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf6P70196 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf6P70196 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf6P70196 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf6P70196 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf6P70196 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf6P70196 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf6P70196 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf6P70196 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf6P70196 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf6P70196 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf6P70196 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf6P70196 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms