Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UbdP63072 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UbdP63072 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UbdP63072 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UbdP63072 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UbdP63072 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UbdP63072 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UbdP63072 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UbdP63072 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UbdP63072 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UbdP63072 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UbdP63072 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UbdP63072 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UbdP63072 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UbdP63072 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UbdP63072 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UbdP63072 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UbdP63072 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UbdP63072 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UbdP63072 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UbdP63072 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UbdP63072 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UbdP63072 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UbdP63072 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UbdP63072 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UbdP63072 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UbdP63072 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UbdP63072 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UbdP63072 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UbdP63072 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UbdP63072 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UbdP63072 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UbdP63072 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UbdP63072 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UbdP63072 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UbdP63072 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UbdP63072 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UbdP63072 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UbdP63072 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UbdP63072 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UbdP63072 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UbdP63072 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UbdP63072 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UbdP63072 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UbdP63072 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UbdP63072 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UbdP63072 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UbdP63072 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UbdP63072 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UbdP63072 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UbdP63072 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UbdP63072 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UbdP63072 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UbdP63072 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UbdP63072 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UbdP63072 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UbdP63072 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UbdP63072 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UbdP63072 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UbdP63072 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UbdP63072 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UbdP63072 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UbdP63072 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UbdP63072 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UbdP63072 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
UbdP63072 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UbdP63072 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UbdP63072 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UbdP63072 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UbdP63072 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UbdP63072 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UbdP63072 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UbdP63072 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UbdP63072 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UbdP63072 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UbdP63072 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UbdP63072 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UbdP63072 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UbdP63072 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UbdP63072 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UbdP63072 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UbdP63072 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UbdP63072 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UbdP63072 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UbdP63072 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UbdP63072 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UbdP63072 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UbdP63072 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UbdP63072 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UbdP63072 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UbdP63072 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UbdP63072 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UbdP63072 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UbdP63072 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UbdP63072 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UbdP63072 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UbdP63072 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UbdP63072 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UbdP63072 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UbdP63072 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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