Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arl1P61211 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arl1P61211 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arl1P61211 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arl1P61211 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arl1P61211 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arl1P61211 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arl1P61211 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arl1P61211 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arl1P61211 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arl1P61211 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arl1P61211 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arl1P61211 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Arl1P61211 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arl1P61211 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl1P61211 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl1P61211 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arl1P61211 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms