Protein–RNA interactions for Protein: P60003

Elof1, Transcription elongation factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elof1P60003 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elof1P60003 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elof1P60003 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elof1P60003 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elof1P60003 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elof1P60003 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elof1P60003 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elof1P60003 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Elof1P60003 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elof1P60003 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elof1P60003 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elof1P60003 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms