Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Wdhd1P59328 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Wdhd1P59328 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Wdhd1P59328 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Wdhd1P59328 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Wdhd1P59328 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Wdhd1P59328 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Wdhd1P59328 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Wdhd1P59328 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Wdhd1P59328 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Wdhd1P59328 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Wdhd1P59328 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Wdhd1P59328 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Wdhd1P59328 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms