Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk2P58801 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk2P58801 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ripk2P58801 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ripk2P58801 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ripk2P58801 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk2P58801 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk2P58801 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk2P58801 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk2P58801 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk2P58801 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk2P58801 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk2P58801 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ripk2P58801 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk2P58801 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk2P58801 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk2P58801 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ripk2P58801 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk2P58801 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk2P58801 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ripk2P58801 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms