Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp25P57080 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp25P57080 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp25P57080 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp25P57080 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp25P57080 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp25P57080 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp25P57080 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp25P57080 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp25P57080 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp25P57080 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp25P57080 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp25P57080 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp25P57080 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp25P57080 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp25P57080 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp25P57080 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp25P57080 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp25P57080 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp25P57080 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp25P57080 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp25P57080 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp25P57080 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp25P57080 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp25P57080 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp25P57080 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp25P57080 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp25P57080 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp25P57080 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp25P57080 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp25P57080 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp25P57080 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp25P57080 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp25P57080 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp25P57080 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp25P57080 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms