Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rp1P56716 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rp1P56716 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rp1P56716 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rp1P56716 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rp1P56716 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rp1P56716 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rp1P56716 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rp1P56716 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rp1P56716 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rp1P56716 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rp1P56716 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rp1P56716 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rp1P56716 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rp1P56716 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rp1P56716 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rp1P56716 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rp1P56716 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rp1P56716 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rp1P56716 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rp1P56716 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rp1P56716 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rp1P56716 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rp1P56716 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rp1P56716 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rp1P56716 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rp1P56716 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rp1P56716 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rp1P56716 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rp1P56716 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rp1P56716 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rp1P56716 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rp1P56716 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rp1P56716 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rp1P56716 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rp1P56716 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rp1P56716 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rp1P56716 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rp1P56716 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rp1P56716 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rp1P56716 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rp1P56716 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rp1P56716 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Rp1P56716 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rp1P56716 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rp1P56716 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rp1P56716 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rp1P56716 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rp1P56716 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rp1P56716 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rp1P56716 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rp1P56716 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rp1P56716 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rp1P56716 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rp1P56716 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rp1P56716 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rp1P56716 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms