Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TdgP56581 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TdgP56581 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TdgP56581 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TdgP56581 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TdgP56581 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TdgP56581 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TdgP56581 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TdgP56581 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TdgP56581 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TdgP56581 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TdgP56581 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TdgP56581 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TdgP56581 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TdgP56581 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TdgP56581 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TdgP56581 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TdgP56581 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TdgP56581 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TdgP56581 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TdgP56581 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TdgP56581 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TdgP56581 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TdgP56581 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TdgP56581 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TdgP56581 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TdgP56581 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TdgP56581 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TdgP56581 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TdgP56581 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TdgP56581 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TdgP56581 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TdgP56581 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TdgP56581 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TdgP56581 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TdgP56581 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TdgP56581 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TdgP56581 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TdgP56581 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TdgP56581 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TdgP56581 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TdgP56581 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TdgP56581 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TdgP56581 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TdgP56581 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TdgP56581 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TdgP56581 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TdgP56581 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TdgP56581 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TdgP56581 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TdgP56581 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TdgP56581 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TdgP56581 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TdgP56581 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TdgP56581 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TdgP56581 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TdgP56581 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TdgP56581 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TdgP56581 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TdgP56581 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TdgP56581 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TdgP56581 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TdgP56581 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TdgP56581 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TdgP56581 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TdgP56581 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TdgP56581 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TdgP56581 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TdgP56581 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TdgP56581 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TdgP56581 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TdgP56581 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TdgP56581 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TdgP56581 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TdgP56581 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TdgP56581 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TdgP56581 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TdgP56581 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TdgP56581 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TdgP56581 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TdgP56581 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TdgP56581 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TdgP56581 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TdgP56581 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TdgP56581 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TdgP56581 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TdgP56581 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TdgP56581 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TdgP56581 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TdgP56581 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TdgP56581 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TdgP56581 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TdgP56581 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TdgP56581 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TdgP56581 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TdgP56581 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TdgP56581 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TdgP56581 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TdgP56581 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TdgP56581 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms