Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp5g3P56384 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5g3P56384 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5g3P56384 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp5g3P56384 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5g3P56384 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5g3P56384 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5g3P56384 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5g3P56384 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5g3P56384 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5g3P56384 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5g3P56384 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms