Protein–RNA interactions for Protein: P52787

Gif, Gastric intrinsic factor, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GifP52787 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GifP52787 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GifP52787 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GifP52787 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GifP52787 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GifP52787 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GifP52787 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GifP52787 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GifP52787 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GifP52787 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GifP52787 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GifP52787 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GifP52787 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GifP52787 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GifP52787 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GifP52787 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GifP52787 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GifP52787 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GifP52787 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GifP52787 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GifP52787 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GifP52787 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GifP52787 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GifP52787 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GifP52787 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GifP52787 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GifP52787 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GifP52787 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GifP52787 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GifP52787 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GifP52787 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GifP52787 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GifP52787 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GifP52787 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GifP52787 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GifP52787 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GifP52787 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GifP52787 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GifP52787 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GifP52787 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GifP52787 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GifP52787 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GifP52787 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GifP52787 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GifP52787 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GifP52787 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GifP52787 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GifP52787 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GifP52787 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GifP52787 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GifP52787 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GifP52787 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GifP52787 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GifP52787 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GifP52787 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GifP52787 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GifP52787 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GifP52787 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GifP52787 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GifP52787 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GifP52787 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GifP52787 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GifP52787 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GifP52787 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GifP52787 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GifP52787 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GifP52787 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GifP52787 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GifP52787 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GifP52787 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GifP52787 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GifP52787 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GifP52787 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GifP52787 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GifP52787 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GifP52787 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GifP52787 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GifP52787 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GifP52787 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GifP52787 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GifP52787 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GifP52787 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GifP52787 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GifP52787 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GifP52787 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GifP52787 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GifP52787 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GifP52787 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GifP52787 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GifP52787 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GifP52787 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GifP52787 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GifP52787 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GifP52787 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GifP52787 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GifP52787 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GifP52787 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GifP52787 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GifP52787 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GifP52787 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms