Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Aff3P51827 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Aff3P51827 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Aff3P51827 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Aff3P51827 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Aff3P51827 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Aff3P51827 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Aff3P51827 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Aff3P51827 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Aff3P51827 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Aff3P51827 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Aff3P51827 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Aff3P51827 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Aff3P51827 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Aff3P51827 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Aff3P51827 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Aff3P51827 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Aff3P51827 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Aff3P51827 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Aff3P51827 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Aff3P51827 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Aff3P51827 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Aff3P51827 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aff3P51827 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aff3P51827 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aff3P51827 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Aff3P51827 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Aff3P51827 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Aff3P51827 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Aff3P51827 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Aff3P51827 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Aff3P51827 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Aff3P51827 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Aff3P51827 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Aff3P51827 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Aff3P51827 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Aff3P51827 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Aff3P51827 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Aff3P51827 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Aff3P51827 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Aff3P51827 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Aff3P51827 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Aff3P51827 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Aff3P51827 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Aff3P51827 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Aff3P51827 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Aff3P51827 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Aff3P51827 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Aff3P51827 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Aff3P51827 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Aff3P51827 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Aff3P51827 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Aff3P51827 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Aff3P51827 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Aff3P51827 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aff3P51827 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Aff3P51827 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Aff3P51827 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Aff3P51827 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Aff3P51827 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aff3P51827 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aff3P51827 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aff3P51827 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aff3P51827 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Aff3P51827 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Aff3P51827 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Aff3P51827 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Aff3P51827 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms