Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CntfP51642 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CntfP51642 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CntfP51642 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CntfP51642 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CntfP51642 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CntfP51642 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CntfP51642 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CntfP51642 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CntfP51642 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CntfP51642 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CntfP51642 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CntfP51642 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CntfP51642 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CntfP51642 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CntfP51642 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CntfP51642 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CntfP51642 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CntfP51642 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CntfP51642 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CntfP51642 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CntfP51642 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CntfP51642 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CntfP51642 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CntfP51642 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CntfP51642 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CntfP51642 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CntfP51642 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CntfP51642 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CntfP51642 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CntfP51642 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CntfP51642 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CntfP51642 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CntfP51642 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CntfP51642 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CntfP51642 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CntfP51642 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CntfP51642 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CntfP51642 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CntfP51642 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CntfP51642 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CntfP51642 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CntfP51642 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CntfP51642 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CntfP51642 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CntfP51642 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CntfP51642 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CntfP51642 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CntfP51642 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CntfP51642 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CntfP51642 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CntfP51642 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CntfP51642 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CntfP51642 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CntfP51642 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CntfP51642 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CntfP51642 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CntfP51642 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CntfP51642 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CntfP51642 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CntfP51642 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CntfP51642 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CntfP51642 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CntfP51642 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CntfP51642 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CntfP51642 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntfP51642 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntfP51642 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntfP51642 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntfP51642 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntfP51642 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CntfP51642 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CntfP51642 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CntfP51642 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CntfP51642 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CntfP51642 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CntfP51642 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CntfP51642 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CntfP51642 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CntfP51642 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CntfP51642 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CntfP51642 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CntfP51642 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CntfP51642 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CntfP51642 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CntfP51642 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CntfP51642 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CntfP51642 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CntfP51642 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CntfP51642 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CntfP51642 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CntfP51642 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CntfP51642 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CntfP51642 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CntfP51642 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CntfP51642 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CntfP51642 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CntfP51642 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CntfP51642 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CntfP51642 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms