Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RoraP51448 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RoraP51448 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RoraP51448 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RoraP51448 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RoraP51448 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RoraP51448 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RoraP51448 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RoraP51448 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RoraP51448 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RoraP51448 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RoraP51448 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RoraP51448 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RoraP51448 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RoraP51448 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RoraP51448 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RoraP51448 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RoraP51448 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RoraP51448 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RoraP51448 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RoraP51448 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RoraP51448 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RoraP51448 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RoraP51448 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RoraP51448 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RoraP51448 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RoraP51448 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RoraP51448 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RoraP51448 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RoraP51448 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RoraP51448 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RoraP51448 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RoraP51448 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RoraP51448 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RoraP51448 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RoraP51448 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RoraP51448 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RoraP51448 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RoraP51448 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RoraP51448 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RoraP51448 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RoraP51448 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RoraP51448 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RoraP51448 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RoraP51448 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RoraP51448 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RoraP51448 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RoraP51448 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RoraP51448 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RoraP51448 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RoraP51448 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RoraP51448 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RoraP51448 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RoraP51448 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RoraP51448 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RoraP51448 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RoraP51448 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RoraP51448 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RoraP51448 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RoraP51448 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RoraP51448 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RoraP51448 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RoraP51448 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RoraP51448 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RoraP51448 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RoraP51448 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RoraP51448 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RoraP51448 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RoraP51448 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RoraP51448 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RoraP51448 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RoraP51448 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RoraP51448 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RoraP51448 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RoraP51448 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RoraP51448 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RoraP51448 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RoraP51448 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RoraP51448 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RoraP51448 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RoraP51448 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RoraP51448 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RoraP51448 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RoraP51448 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RoraP51448 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RoraP51448 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RoraP51448 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RoraP51448 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RoraP51448 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RoraP51448 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RoraP51448 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RoraP51448 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RoraP51448 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RoraP51448 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RoraP51448 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RoraP51448 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RoraP51448 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RoraP51448 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RoraP51448 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RoraP51448 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms