Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MipP51180 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MipP51180 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MipP51180 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MipP51180 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MipP51180 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MipP51180 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MipP51180 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MipP51180 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MipP51180 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MipP51180 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MipP51180 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MipP51180 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MipP51180 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MipP51180 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MipP51180 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MipP51180 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MipP51180 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MipP51180 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MipP51180 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MipP51180 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MipP51180 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MipP51180 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MipP51180 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MipP51180 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MipP51180 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MipP51180 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MipP51180 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MipP51180 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MipP51180 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MipP51180 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MipP51180 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MipP51180 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MipP51180 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MipP51180 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MipP51180 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MipP51180 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MipP51180 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MipP51180 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MipP51180 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MipP51180 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MipP51180 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MipP51180 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MipP51180 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MipP51180 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MipP51180 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MipP51180 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MipP51180 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MipP51180 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MipP51180 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MipP51180 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MipP51180 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MipP51180 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MipP51180 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MipP51180 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MipP51180 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MipP51180 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MipP51180 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MipP51180 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MipP51180 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MipP51180 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MipP51180 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MipP51180 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MipP51180 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MipP51180 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MipP51180 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MipP51180 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MipP51180 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MipP51180 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MipP51180 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MipP51180 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MipP51180 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MipP51180 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MipP51180 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MipP51180 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MipP51180 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MipP51180 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MipP51180 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MipP51180 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MipP51180 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MipP51180 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MipP51180 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MipP51180 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MipP51180 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MipP51180 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MipP51180 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MipP51180 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MipP51180 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MipP51180 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MipP51180 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MipP51180 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MipP51180 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MipP51180 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MipP51180 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MipP51180 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MipP51180 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MipP51180 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MipP51180 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MipP51180 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MipP51180 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms