Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa10P50708 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa10P50708 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa10P50708 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa10P50708 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa10P50708 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa10P50708 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa10P50708 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa10P50708 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa10P50708 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.1 ms