Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Rnf19aP50636 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Rnf19aP50636 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Rnf19aP50636 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Rnf19aP50636 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Rnf19aP50636 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Rnf19aP50636 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Rnf19aP50636 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Rnf19aP50636 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Rnf19aP50636 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Rnf19aP50636 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Rnf19aP50636 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Rnf19aP50636 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rnf19aP50636 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rnf19aP50636 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rnf19aP50636 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Rnf19aP50636 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Rnf19aP50636 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Rnf19aP50636 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Rnf19aP50636 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Rnf19aP50636 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rnf19aP50636 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rnf19aP50636 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rnf19aP50636 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Rnf19aP50636 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Rnf19aP50636 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Rnf19aP50636 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Rnf19aP50636 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Rnf19aP50636 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Rnf19aP50636 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Rnf19aP50636 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Rnf19aP50636 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Rnf19aP50636 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Rnf19aP50636 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Rnf19aP50636 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Rnf19aP50636 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Rnf19aP50636 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rnf19aP50636 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rnf19aP50636 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rnf19aP50636 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Rnf19aP50636 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Rnf19aP50636 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Rnf19aP50636 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rnf19aP50636 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rnf19aP50636 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rnf19aP50636 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rnf19aP50636 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rnf19aP50636 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Rnf19aP50636 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rnf19aP50636 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Rnf19aP50636 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rnf19aP50636 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,57■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Rnf19aP50636 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rnf19aP50636 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rnf19aP50636 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rnf19aP50636 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rnf19aP50636 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Rnf19aP50636 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rnf19aP50636 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rnf19aP50636 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rnf19aP50636 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Rnf19aP50636 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Rnf19aP50636 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Rnf19aP50636 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Rnf19aP50636 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rnf19aP50636 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rnf19aP50636 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rnf19aP50636 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rnf19aP50636 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rnf19aP50636 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rnf19aP50636 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rnf19aP50636 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rnf19aP50636 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Rnf19aP50636 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,8 ms